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PCR檢查支原體是對藥典方法的重要補充

更新時間:2020-11-13  |  點擊率:689

 

支原體是導致體外細胞污染的重要污染源。用于生物制品生產(chǎn)的細胞基質(zhì)或治療性細胞。產(chǎn)品被支原體污染后,支原體或支原體代謝產(chǎn)物可進入人體,并對人體產(chǎn)生嚴重危害。因此,對支原體污染的有效檢測是確保細胞基質(zhì)及治療性細胞產(chǎn)品質(zhì)量的前提。


支原體傳統(tǒng)檢測方法為培養(yǎng)法和指示細胞染色法,這兩種均是“藥典方法”。但缺點是耗時長,靈敏度低。此外,這兩種方法均無法明確所感染支原體的類型。

因此,采用PCR或qPCR檢測支原體的高度保守序列,用于制藥工業(yè)的放行檢測,逐漸成為一種趨勢。當然,核酸擴增法也存在一定的問題,因為它檢的不是活的支原體,而是支原體的DNA。另外,它容易受到樣本基質(zhì)中的物質(zhì)干擾,如果靈敏度達不到,有時容易漏檢。而培養(yǎng)法的問題是,有些支原體無法在培養(yǎng)基上生長,因此也不會被發(fā)現(xiàn)。而核酸擴增法可以覆蓋100多種支原體,且大大節(jié)省時間,并且擴增產(chǎn)物還可測序,以終確定污染支原體的物種,增加可追溯性。因此還是值得大力推廣。

現(xiàn)在,市面上有些商品化試劑盒可以挑選,但需要注意它們應(yīng)達到歐洲藥典或日本藥典標準,例如靈敏度、耐用性和特異性方面,需要經(jīng)過全面驗證。下面以德國MB公司的試劑盒(Venor®GeM qEP)為例,對這類試劑盒略做介紹。

該試劑盒擴增柔膜體對應(yīng)的16S rRNA上的特異序列, 而真核細胞和其他細菌DNA不會被擴增。
 
試劑盒可同時對細胞培養(yǎng)上清篩查以及那些需要遵循歐洲藥典和日本藥典放行檢測。整個檢測小于3小時。和一些生化和細胞學方法相比,PCR具有更高的靈敏度和準確性。
 
試劑盒包含所有必要的PCR組分,包括引物和探針。其中內(nèi)控DNA可用于鑒定PCR抑制或DNA抽提問題帶來的假陰性。內(nèi)控DNA可直接加到PCR預(yù)混液里,或加到DNA抽提之前的樣本中。它可用于驗證DNA抽提和qPCR擴增過程。內(nèi)控對照的擴增結(jié)果在560nm檢測(HEX通道),而支原體的擴增在520nm檢測(FAM通道)。
 
試劑盒包括dUTP,它替代dTTP,方便用尿嘧啶DNA糖基酶(UNG)監(jiān)視假陽性。該試劑盒不包含UNG。

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